Los mejores programas de facturación para autónomos y pymes en 2025

Validado por
Lluís Soler Gomis
Actualizado el 07/03/2025

El éxito de un autónomo depende del valor añadido que pueda ofrecer en sus servicios y productos. Para mejorar su eficiencia, deberá simplificar sus principales tareas diarias, como es la emisión de facturas. Podemos encontrar multitud de programas de diseño de facturas, pero desde SoftDoit, como expertos del sector, queremos que descubras cuáles son los que mejor se adaptan a tus necesidades concretas.

Los 7 mejores programas de facturación para autónomos y pymes

Un software de facturación para autónomos y pymes te permitirá agilizar y automatizar la gestión de tu negocio de manera sencilla, y así puedas dedicar ese tiempo y esfuerzo en dar valor a tu empresa.

Para ayudarte a elegir el más adecuado, hemos creado un listado con las mejores aplicaciones de este año, teniendo en cuenta sus funcionalidades, facilidad de uso, integraciones, precios y servicio de atención al cliente.

Índice de contenidos (13)

Que es un programa de facturacion
Caracteristicas de un software de facturacion para pymes y autonomos
Lista de los 7 programas de facturacion para autonomos
Tipos de programas facturacion para autonomos
Que tener en cuenta para elegir un programa de gestion para autonomos
Conclusion: El mejor software para autonomos

Qué es un programa de facturación

La correcta gestión de cobros y pagos es uno de los grandes quebraderos de cabeza de un autónomo, por no hablar del cumplimiento de las declaraciones legales dentro del periodo establecido.

Facturas, gastos, movimientos bancarios, tributaciones... son muchas las tareas administrativas que hay que llevar a cabo de manera rigurosa para sacar adelante un negocio. Por eso es importante poder contar con un software de gestión eficiente pero sencillo, que se adapte al trabajo diario de un emprendedor o pequeña empresa.

Un programa de facturación para autónomos es una herramienta diseñada para automatizar el proceso de creación, gestión y envío de facturas.
Lograrás emitir documentos precisos y con diseños profesionales, asegurar el cumplimiento de las normativas fiscales, acelerar el proceso de cobro y reducir la carga administrativa, ahorrando un valioso tiempo y esfuerzo.
También podrás realizar un seguimiento del estado de los pagos, gestionar el flujo de caja y obtener informes para entender el estado financiera de tu empresa.

Desde SoftDoit, te ayudamos a que conozcas los mejores programas de este año.

Características de un software de facturación para pymes y autónomos

Un programa de facturación para autónomos y pymes es ligero y económicamente asequible, ofrece las funcionalidades necesarias y no requiere de conocimientos contables ni informáticos para su uso.

Gracias a él, podrás personalizar facturas con el logo de la empresa, automatizar su creación y envío electrónico, desglosar diferentes tipos de IVA o aplicar descuentos por producto o servicio.

También permite integrar albaranes al sistema, clasificar las facturas por su estado, comunicar impagos, transformar presupuestos en facturas, realizar la conciliación bancaria o presentar modelos tributarios.

Veamos sus principales características:

Automatización. Automatiza la generación de facturas, el seguimiento de los pagos y el envío de recordatorios a clientes.

Personalización. Integra plantillas predefinidas que puedes personalizar con tu logotipo, datos de contacto y detalles de tus productos y servicios.
Gestión de clientes y proveedores. Almacena información de contacto, términos de pago y preferencias de facturación.
Integración. Sincroniza datos con otras herramientas contables y sistemas bancarios para un mayor control financiero.
Accesibilidad. Gestiona la facturación desde cualquier lugar, ya que podrás acceder a él desde diferentes plataformas, ya sea un ordenador, un tablet o tu teléfono móvil.
Cumplimiento normativo. Se actualiza con las normas fiscales vigentes y cumple con los requisitos de la factura electrónica.
Análisis. Genera informes para identificar tendencias de ventas, fuentes de ingresos, cuentas por cobrar o tu rendimiento financiero.

Destacado

Tabla comparativa de los top 4 programas de facturación para autónomos y pymes

Antes de entrar en detalle con sus características, te mostramos un resumen para que compruebes, de forma visual, en qué destaca cada solución.

Solución	Prestaciones	App	Precios	Valoración	Más info
a3factura	Bancos Portal de facturas Fact. recurrentes	App móvil	Desde 9,95 €/mes	4.7/5	Ver a3factura o compara entre más de 94 soluciones
Sage 50	Cálculo impuestos Bancos Portal de facturas Fact. recurrentes		Desde 45 €/mes	4.8/5	Ver Sage 50 o compara entre más de 94 soluciones
Zimasoft	Cálculo impuestos Bancos Portal de facturas Fact. recurrentes		Desde 10 €/mes	4.4/5	Ver Zimasoft o compara entre más de 94 soluciones
Prana Software	Cálculo impuestos Bancos Portal de facturas Fact. recurrentes		Desde 19 €/mes	4.7/5	Ver Prana Software o compara entre más de 94 soluciones
Quipu	Cálculo impuestos Bancos Portal de facturas Fact. recurrentes	App móvil	Desde 13 €/mes	4.6/5	Descuento para Quipu o compara entre más de 94 soluciones
Qonto	Cálculo impuestos Bancos	App móvil	Desde 11 €/mes	4.7/5	Descuento para Qonto o compara entre más de 94 soluciones
FacturaDirecta	Cálculo impuestos Bancos Portal de facturas Fact. recurrentes	App móvil	Desde 10 €/mes	4.7/5	Sobre FacturaDirecta

Lista de los 7 programas de facturación para autónomos

1. Wolters Kluwer: a3factura

a3factura es un software online, sencillo, eficiente e intuitivo. Está disponible en dos versiones, go y pro, para adaptarse a las necesidades de facturación de la pequeña empresa y a su crecimiento.

Características

Cuenta con una estructura muy visual, lo que permite personalizar fácilmente facturas y enviarlas a los clientes. Gracias a su sistema de avisos, sabrás cuándo han sido descargadas por el destinatario.
Sistema multiusuario y con la posibilidad de dar acceso directo a tu asesor para el intercambio de documentos.
Permite integrar capturas de móvil de tus tickets de gasto.
Emite facturas electrónicas y te asegura el cumplimiento normativo.
Su cuadro de mando permite controlar tu negocio de un vistazo con los principales indicadores.

Planes y precios

Podrás disfrutar de a3factura desde 9,95 € al mes. Para funcionalidades extra como control stock o usuarios ilimitados, el plan es de 39 €/mes.

programa facturacion autonomos a3factura

Ventajas

Máxima garantía en su actualización a las normativas
Soluciones flexibles y modulares
Portal colaborativo para tu asesor

Inconvenientes

No indicado para empresas de fuera de España

Valoración

Puntuación general
Valoración

4.7/5

Funcionalidades

4.7

Atención al cliente

4.9

Facilidad de uso

4.4

Integraciones

4.8

Más información sobre a3factura

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2. Sage 50

Sage 50 es un sencillo y rápido programa de contabilidad para autónomos en la nube que integra también la gestión comercial de tu negocio.

Características

Desarrollado con tecnología avanzada en movilidad, seguridad y colaboración online.
Ofrece una gestión integrada de ventas, compras y stock.
Es capaz de integrar presupuestos con facturación y, automáticamente, con la contabilidad, de forma que se evitan errores y se ahorra mucho tiempo.
Crea facturas profesionales, reclama cobros pendientes y sincroniza tus movimientos bancarios.
Personalizable según tu tipo de actividad y con soporte técnico para ayudarte a crecer.

Planes y precios

Sage 50 ofrece tres modelos de precios: Essential, Standard y Premium, que va desde los 45 € al mes hasta los 160 €.

programa de contabilidad para autónomos Sage 50

Ventajas

Gestión comercial incluida
Contabilidad colaborativa
Visión de futuro de tu liquidez

Inconvenientes

Limitaciones en términos de personalización

Valoración

Puntuación general
Valoración

4.8/5

Funcionalidades

4.8

Atención al cliente

Facilidad de uso

4.5

Integraciones

4.9

Más información sobre Sage 50

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3. ZimaSoft

ZimaSoft es un software online cómodo, intuitivo y fácil, con todas las opciones que necesitas para potenciar tu negocio y simplificar gestiones, ahorrando tiempo y dinero.

Características

Además de automatizar la facturación de tu pequeña empresa, dispondrás de un módulo CRM y de circuitos comerciales para compras, ventas y stock con una amplia variedad de funciones.
Su módulo de Tesorería permite remesar y controlar los pagos con agilidad.
Permite crear presupuestos y facturas en segundos y configurar impuestos.
También podrás conocer la rentabilidad de tus proyectos y administrar tus relaciones comerciales con proveedores y clientes.
Además de sus tres versiones estándares, dispone de otras personalizadas.

Planes y precios

Cuenta con un plan básico de 10 € al mes por usuario para la facturación y, dependiendo de los módulos que vayamos agregando, la cuota se va ajustando.

Ventajas

Presentación online de modelos tributarios
Ofrece un módulo básico para autónomos que solo quieren facturar
Conciliación bancaria automática

Inconvenientes

No digitaliza tickets de gasto

Valoración

Puntuación general
Valoración

4.4/5

Funcionalidades

4.2

Atención al cliente

4.8

Facilidad de uso

4.3

Integraciones

4.4

Más información sobre Zimasoft

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4. Prana Software

Prana Software es un software de facturación para autónomos que simplifica la creación de facturas, presupuestos y proformas, asegurando además el cumplimiento normativo con VeriFactu, la Ley Antifraude y la Ley Crea y Crece.

Características

Con una interfaz muy visual, permite generar documentos en segundos, completando automáticamente los campos con datos del cliente y del negocio.
Además de facturar, Prana facilita el control de gastos al digitalizar tickets y organizar automáticamente las categorías, evitando errores y olvidos.
También ofrece un módulo de tesorería, que conecta con las cuentas bancarias para conciliar movimientos y obtener una visión clara del flujo de caja.
El software incorpora funciones clave para la presentación de impuestos, permitiendo al autónomo cumplir fácilmente con sus obligaciones fiscales.
Gracias a su conexión directa con el asesor, facilita el intercambio de documentos y agiliza el trabajo contable.
Con Prana, los emprendedores pueden tener todo su negocio bajo control, desde la facturación y la contabilidad, hasta la gestión financiera y el inventario, todo en una única plataforma, accesible desde cualquier dispositivo.

Planes y precios

Dispone de un plan esencial para un usuario por 19€/mes.

Ventajas

Generar facturas en segundos, con campos autocompletados y plantillas personalizables.
Cada factura emitida o recibida se registra automáticamente en el sistema contable y se vincula al flujo de caja.
Permite compartir facturas e informes directamente con el asesor.

Inconvenientes

No incluye sistema de pagos online.

Valoración

Puntuación general
Valoración

4.7/5

Funcionalidades

4.8

Atención al cliente

4.7

Facilidad de uso

4.8

Integraciones

4.6

Más información sobre Prana Software

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5. Quipu

Quipu es un software de facturación para autónomos que facilita la gestión contable y fiscal de manera rápida y eficiente.

Ofrece una plataforma todo-en-uno que permite gestionar facturas, tesorería, impuestos y clientes en un solo lugar.

Características

Con Quipu, los usuarios pueden crear facturas personalizadas, presupuestos y albaranes, y enviarlos directamente desde la plataforma.
Automatiza tareas recurrentes como la generación de facturas periódicas, rellena automáticamente modelos tributarios y permite la conciliación bancaria para controlar pagos y cobros de manera sencilla.
El programa también cuenta con herramientas de digitalización de documentos y tickets.
Ofrece un panel de control centralizado que permite visualizar ingresos, gastos y el estado financiero del negocio en tiempo real.
Quipu se integra con más de 200 aplicaciones y cuenta con app móvil.

Precios

A partir de 13 € al mes ya tienes el plan starter, adaptado para autónomos.

programas de facturacion para autónomos Quipu

Ventajas

Rellena y presenta formularios de impuestos desde su panel de control.
Conciliación bancario y conexión con tiendas online
Genera facturas recurrentes, proformas y rectificativas

Inconvenientes

Previsión de tesorería o proyección de vencimientos, solo disponibles en el plan Premium

Valoración

Puntuación general
Valoración

4.6/5

Funcionalidades

4.7

Atención al cliente

4.6

Facilidad de uso

4.6

Integraciones

4.7

Más información sobre Quipu

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6. Qonto

Qonto es una buena opción para pequeñas empresas que buscan una solución simple e integrada para gestionar facturación y finanzas. Incluye funcionalidades de banca online con herramientas de gestión administrativa.

Características

Los autónomos y pymes pueden generar facturas adaptadas a sus necesidades, personalizando su diseño.
Permite gestionar todas las facturas emitidas y recibidas desde un único panel, y se vinculan automáticamente con los movimientos bancarios registrados.
Se adapta bien a autónomos con clientes regulares, ya que permite configurar facturas automáticas para servicios o suscripciones.
Ayuda a organizar el IVA y otras obligaciones fiscales, envía alertas automáticas a los clientes para recordarles el pago de facturas pendientes y permite escanear tickets y recibos desde la app móvil.

Planes y precios

Dispone de planes para autónomos desde 11 € al mes con facturación integrada.

Ventajas

Combina facturación con gestión bancaria y control de gastos.
Como cuenta de empresa, ofrece transferencias inmediatas gratuitas, tarjetas físicas y virtuales.
Automatiza los principales procesos relacionados con facturas y pagos.

Inconvenientes

No permite generar y presentar online los modelos tributarios.

Valoración

Puntuación general
Valoración

4.7/5

Funcionalidades

4.7

Atención al cliente

4.6

Facilidad de uso

4.8

Integraciones

4.7

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7. FacturaDirecta

FacturaDirecta es una herramienta de facturas para autónomos que buscan una solución sencilla, accesible y económica.

Su facilidad de uso y automatización de procesos clave lo convierten en una buena opción para quienes manejan operaciones simples.

Características

Su diseño intuitivo y funcionalidades específicas para pequeñas operaciones hacen que sea una herramienta eficiente para generar y controlar facturas.
Permite generar facturas profesionales en segundos, y convierte automáticamente presupuestos en facturas y gestiona albaranes asociados a cada transacción.
Configura facturas automáticas para clientes habituales o servicios periódicos, calcula y organiza impuestos y facilita la preparación de modelos fiscales para autónomos.
También organiza y clasifica los movimientos financieros, ofreciendo una visión clara del flujo de caja.

Planes y precios

Ofrece de un plan gratuito pero muy limitado. El plan básico lo puedes adquirir por 10 euros al mes.

facturación para autónomos FacturaDirecta

Ventajas

Proporciona informes sobre ingresos, gastos, impuestos y rentabilidad.
Facilita la colaboración con asesores fiscales con acceso a FacturaDirecta.
Ofrece planes de suscripción accesibles, ideales para pequeñas empresas.

Inconvenientes

Aunque cumple con las necesidades básicas, puede quedarse corto para compañías grandes o con requerimientos contables más complejos.

Valoración

Puntuación general
Valoración

4.7/5

Funcionalidades

4.7

Atención al cliente

4.8

Facilidad de uso

4.8

Integraciones

4.5

Más información sobre FacturaDirecta

Ficha

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Preguntas: 1/8

Tipos de programas facturación para autónomos

Sistemas cloud: Se ejecutan en servidores remotos y son accesibles a través de internet, ya que almacenan los datos en la nube. Son ideales para los que buscan accesibilidad en movimiento y no quieren preocuparse por actualizaciones o mantenimiento de software.

Software de escritorio: Se ejecutan en el propio ordenador y almacenan la información de forma local. Aunque requieren instalación, y a veces mantenimiento manual, ofrecen mayor control sobre la seguridad de los datos.

App móvil: Muchos cuentan con su propia aplicación móvil, diseñada específicamente para trabajar cómodamente desde un smartphone o tablet.

Qué tener en cuenta para elegir un programa de gestión para autónomos

Facilidad de uso: Elige un software intuitivo y fácil de navegar para minimizar la curva de aprendizaje.
Características específicas: Identifica las funciones que necesitas, como la conectividad con bancos, la gestión de inventarios o la digitalización de tickets de gasto.
Soporte técnico y formación: Ten en cuenta la calidad y la disponibilidad del soporte técnico que ofrece el proveedor, así como si cuenta con recursos de formación para aprovechar al máximo el software.
Coste: Evalúa la estructura de precios del software para asegurarte de que se ajusta a tu presupuesto.
Actualizaciones y mantenimiento: Comprueba que el software se actualice regularmente para adaptarse a las nuevas normativas fiscales y mejoras tecnológicas.

Un software de facturación para autónomos es un programa ágil, muy asequible y con las funciones necesarias para simplificar la gestión del negocio y automatizar la facturación.

Conclusión: El mejor software para autónomos

Como has podido comprobar, encontrar el mejor software de facturas para tu pequeña empresa no es tan sencillo como parece. ¿Cómo elegir el programa que realmente se adapta a las necesidades de un autónomo, emprendedor o pyme?

Para eso está SoftDoit, la primera consultora online en España de software empresarial.

Tan solo tienes que utilizar comparador gratuito de software que aparece en esta misma página para que sepamos qué prestaciones necesitas; no tardarás ni un minuto.
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Los mejores programas de facturación para autónomos

Vídeo con los mejores software de gestión para autónomos de este año.

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Y estos han sido los programas para autónomos recomendados por SoftDoit. ¡Esperamos haberte ayudado! Recuerda que nuestro equipo de expertos está a tu entera disposición. Muchas gracias por confiar en nuestra profesionalidad.

¡Hasta tu próxima aventura digital!

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Lluís Soler GomisCofundador y Director de negocio en SoftDoit

Director de negocio y cofundador de la compañía, es un barcelonés que se ha ganado a pulso su gran reconocimiento en el sector del eBusiness debido a la multitud de iniciativas y empresas que ha creado desde 2005.

Aporta su energética lucha por crear una gran compañía y sus habilidades para la comercialización, el trato humano y el marketing directo. Autor del libro "Pyme minimalista", publicado en 2022.